Titel: API für Abfrage von Taxa und Konzeptbeziehungen aus dem Checklisten-System des Bundesamts für Naturschutz - eine Kooperation zwischen NFDI4Biodiversity und BfN
Vortragende: Elisabeth Huellbusch, Dr. Anton Güntsch
Zielgruppe: Entwicklungen mit NFDI4Biodiversity für die Community
Mini-Abstract:
Biodiversitätsdaten beziehen sich i.d.R. in der Regel auf wissenschaftliche Namen, welche aber oft in verschiedenem taxonomischen Umfang verwendet werden - und somit nicht eindeutig sind. Es ist daher nötig, wissenschaftliche Namen auf einen definierten taxonomischen Umfang /oder ein bestimmtes Taxon zu beziehen (=sogenannte Annotation). Die Voraussetzung dafür ist, dass Taxa-Daten in Form eines semantischen Netzes vorliegen. Im , in dem die Beziehungen der verschiedenen Taxa und Konzepte untereinander enthalten sind. Das “Checklisten (CL)-System” des Bundesamts für Naturschutz dient bereits als essentielles Werkzeug für die Erfassung und Verwaltung von Pflanzen- und Tierdaten in Deutschland. Dort sind bundesweit abgestimmte Checklisten für über 80 Artengruppen hinterlegt. Konzeptbeziehungen Konzeptbeziehungen zwischen Taxa zweier Checklisten geben an, wie sich die Taxonkonzepte zueinander verhalten. BfN und NFDI4Biodiversity haben gemeinsam die öffentliche Webschnittstelle “CL-API” entwickelt, die eine Suche nach Namen bzw. Taxa im CL-System sowie eine Abfrage der Konzeptbeziehungen zwischen diesen erlaubt. Auf diese Weise können zu einem Namen mögliche taxonomische Konzepte angezeigt werden und ggf. gegebenenfalls kann das passende Konzept ausgewählt und referenziert werden.
Website & Ankündigungstext:
Biodiversitätsdaten beziehen sich in der Regel Die technologische Weiterentwicklung ermöglicht damit einen direkten sowie unkomplizierten Zugang zu den gesammelten Daten und verbessert die Interoperabilität mit anderen Forschungsdiensten. In dem Bidoiversitea wird die Schnittstelle vorgestellt und ein Anwendungsbeispiel gezeigt. ??
Für mehr informationen:
Newsartikel (12/23): https://www.nfdi4biodiversity.org/de/news/neue-schnittstelle/
REST-API: https://checklisten.doctronic.de/api/public/swagger-ui
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Biodiversitätsdaten beziehen sich i.d.R. auf wissenschaftliche Namen, welche aber oft in verschiedenem taxonomischen Umfang verwendet werden |
- und somit nicht eindeutig sind. Es ist daher nötig, wissenschaftliche Namen auf einen definierten taxonomischen Umfang |
oder /ein bestimmtes Taxon zu beziehen ( |
sogenannte =Annotation). Die Voraussetzung dafür ist, dass Taxa-Daten in Form eines semantischen Netzes vorliegen |
, in dem die Beziehungen der verschiedenen Taxa und Konzepte untereinander enthalten sind. Das . Im “Checklisten (CL)-System” des Bundesamts für Naturschutz |
dient bereits als essentielles Werkzeug für die Erfassung und Verwaltung von Pflanzen- und Tierdaten in Deutschland. Dort sind bundesweit abgestimmte Checklisten für über 80 Artengruppen hinterlegt. |
Konzeptbeziehungen Konzeptbeziehungen zwischen Taxa zweier Checklisten geben an, wie sich die Taxonkonzepte zueinander verhalten. BfN und NFDI4Biodiversity haben gemeinsam die öffentliche Webschnittstelle “CL-API” entwickelt, die eine Suche nach Namen bzw. Taxa im CL-System sowie eine Abfrage der Konzeptbeziehungen zwischen diesen erlaubt. Auf diese Weise können zu einem Namen mögliche taxonomische Konzepte angezeigt werden und |
gegebenenfalls ggf. kann das passende Konzept ausgewählt und referenziert werden |
. Die technologische Weiterentwicklung ermöglicht damit einen direkten sowie unkomplizierten Zugang zu den gesammelten Daten und verbessert die Interoperabilität mit anderen Forschungsdiensten In dem Bidoiversitea wird die Schnittstelle vorgestellt und ein Anwendungsbeispiel gezeigt. ??Für mehr informationen:
Newsartikel (12/23): https://www.nfdi4biodiversity.org/de/news/neue-schnittstelle/
REST-API: https://checklisten.doctronic.de/api/public/swagger-ui
